Nová pravidla pro odpočet na výzkum a vývoj od 1. ledna 2026

Tomáš Jirásek, Rödl & Partner Praha  

Nově bude možné odpočet uplatnit až v pěti bezprostředně následujících zdaňovacích obdobích namísto původních třech. 

V dosavadní úpravě ZDP platilo pravidlo, že poplatník musel uplatnit odpočet v období, ve kterém vznikl, pokud v tomto období vykázal kladný základ daně. Nebylo tedy možné uplatnit přednostně například slevu na dani či zápočet zahraniční daně, aniž by právo uplatnit odpočet v dalších letech zaniklo. Nově si poplatník bude moci vybrat, ve kterém z celkem šesti období odpočet uplatní. Toto pravidlo nevyužije poplatník s příslibem investiční pobídky.

Dosavadní úprava ZDP umožňovala odečíst odpočet na výzkum a vývoj až do výše součtu 100 procent výdajů vynaložených ve zdaňovacím období, které nepřevyšovaly výdaje na VaV vynaložené v předchozím období, a 110 procent části výdajů, které převyšovaly výdaje vynaložené v předchozím srovnatelném období. Nově bude možné uplatnit 150 procent vynaložených výdajů až do limitu 50 milionů korun za jedno zdaňovací období či období, za které se podává daňové přiznání. Výdaje převyšující tuto částku bude možné uplatnit ve výši 100 procent. Limit se posoudí souhrnně za všechny členy nově zavedeného „odpočtového celku“, a to za období, která končí ve stejném kalendářním roce. U poplatníků, kteří nejsou součástí odpočtového celku, se v případě období kratšího než 12 měsíců limit s přesností na dny poměrně sníží.

Zatímco v rámci dosavadní úpravy fungoval každý poplatník uplatňující odpočet na výzkum a vývoj odděleně, nově bude řešit, zda je či není součástí takzvaného odpočtového celku. Na první pohled složitá konstrukce byla do zákona zavedena z důvodu limitace výdajů ve výši 50 milionů. Zjednodušeně jde o skupinu poplatníků zahrnující ovládající osobu (osoba, která vede účetnictví a není ovládána jinou osobou) a ovládané osoby (osoby, které vedou účetnictví a které ovládá ovládající osoba sama nebo společně s jinou osobou na základě smlouvy, podle které se pro rozhodování využije jednomyslná shoda). Institut odpočtového celku má zabránit přelévání výzkumných aktivit mezi spojenými osobami a tím dosažení vyššího odpočtu. Informace o tom, zda je poplatník členem odpočtového celku a případně jakého, se bude uvádět v daňovém přiznání.

Nově nebude nutné uvádět kvalifikaci a formu pracovněprávního vztahu výzkumných pracovníků k poplatníkovi. 

Aby bylo možné výdaje na VaV vynaložené v daném období považovat za způsobilé uplatnění, bude i nadále nutné schválit projektovou dokumentaci ve lhůtě pro podání daňového přiznání, a to bez ohledu na to, zdali bude odpočet v tomto období uplatněn či nikoliv.

V souvislosti s novelou odpočtu na výzkum a vývoj dochází také ke změnám ustanovení, která využívají poplatníci, jejichž měnou účetnictví není česká koruna.

Na odpočty vzniklé za zdaňovací období, která započala před 1. lednem 2026, se použije úprava ZDP platná do konce roku 2025, tedy uplatní se například dosavadní tříletá přenositelnost odpočtu. 

​